洪水淹没，物资损失则更小，最大的损失则是水军船只。这主要洪水来势极快，蒙军船只根本来不得躲避，加之又多为小船，倒有一半在浪头下倾覆。更下游的嘉定府，则基本没有损失，一方面是俞兴得到霹雳军的示警后早已做了准备，另一方面则是洪峰到达嘉定时已大大削弱，只是比常见的洪水大些而已，只是淹没了两岸不少土地，但并没有对粮食收获造成影响。这是因为嘉定府在川西平原的南边，夏粮收割季节要早十日左右，洪峰到达时早已收割完毕。
滔滔洪水给霹雳军带来的利好不仅仅是削弱了蒙古人，更重要的是让河道变得更加通畅。之前蒙军在彭山城外的河道中设置了大量水障，让霹雳军的重型炮船无法通行，限制了霹雳军这一最大优势武器的发挥，也事实上阻断了霹雳军和嘉定乃至叙州、重庆府的水上通道。之前乐全安曾向欧阳轩汇报过，仅是清理彭山城的河道，需要上千劳力耗时三个月以上。
要说大自然力量实在太强大。如今洪峰一过，不仅蒙军费尽心血设置的水障被一扫而空，甚至不少淤积的沙洲也被冲走，使河道宽度和深度也都增加了不少。霹雳军在冬天曾大规模地疏浚河道，耗费了大量的人力和物力，甚至用了火药爆破这一利器，才好不容易在冬季清理出了勉强供战船通行的水道。此次滔天巨浪所到之处，其对河道清理效果，远胜人工清理效果的百倍以上。
这人工洪水来得快，去得也快。又过了两日，洪水已差不多退去，百姓开始从高处返回家园。在军政会议决定爆破堰塞湖时，欧阳轩让工业公司屯积了大量的生石灰，便是为洪水之后的消毒之用。“大灾之后必有大疫”，此次洪水虽然时间短，但由于正值暑热传染病高发季节，须得加强卫生防疫。百姓在返家之前，李爽已命人分发了生石灰，并编制了卫生防疫的顺口溜叫人背诵传唱，多是饮水要煮沸，大小便要入厕、消灭苍蝇、老鼠、蟑螂等简便易行的内容。